2031 год. Прогресс в области кибернетики позволяет людям заменять конечности на передовые роботизированные протезы. Майор Мотоко Кусанаги из 9-го отдела службы безопасности расследует сложное дело, связанное с загадочным хакером, известным под именем Кукловод.
Её команда сталкивается с серией киберинцидентов, которые бросают вызов существующим системам безопасности. Майор Кусанаги использует свои уникальные кибернетические способности, чтобы раскрыть нити этого запутанного дела, постепенно приближаясь к разгадке таинственной личности хакера.